Μέχρι το Γενάρη του 1974 το 2ο Λύκειο στεγαζόταν στο “Καπετανάκειο”, κοντά στην Πλατεία Ελευθερίας
Από το 1975 θα βρεθεί στο συγκρότημα της οδού Κονδυλάκη και δε θα αργήσει να γίνει ένα από τα πολυπληθέστερα Λύκεια της Ελλάδας. Με την εκπαιδευτική Μεταρρύθμιση, το σχολικό συγκρότημα της οδού Κονδυλάκη στέγαζε το 2ο Ενιαίο Λύκειο μαζί με άλλες 4 σχολικές μονάδες προτού γκρεμιστεί.Το Μάιο του 2002 και ενώ διεξάγονται Πανελλαδικές εξετάσεις για τα Ενιαία Λύκεια και Ενδοσχολικές για τις υπόλοιπες σχολικές μονάδες αποφασίζεται η άμεση εκκένωση του σχολ.συγκροτήματος της οδού Κονδυλάκη και η κατεδάφισή του, λόγω σοβαρότατων προβλημάτων στη στατικότητα των κτιρίων. Τρεις χιλιάδες (3000) μαθητές και μαθήτριες πρέπει άμεσα να στεγαστούν σε άλλα σχολικά συγκροτήματα, κατά το δυνατόν σε γειτονικές περιοχές. Το 2ο Ενιαίο Λύκειο, με 530 μαθητές και 55 καθηγητές ακολουθεί, πλέον ιδιαίτερα δύσκολη πορεία. Υπό τη Διεύθυνση της κ. Αικατερίνης-Έλλης Σκαρβελάκη, Φιλολόγου και με Υποδιευθυντές τον κ. Μανόλη Φλουρή, Γεωπόνο και την κ. Ευρυδίκη-Ελένη Αλεξανδρίδου, Γαλλικής, μεταφέρεται και εγκαθίσταται, μέσα σε λίγες ώρες, η απαραίτητη βασική υποδομή του 2ου Ενιαίου Λυκείου, στο γειτονικό συγκρότημα επί της οδού Φιλιππουπόλεως, όπου στεγάζονται σε δύο πτέρυγες το 4ο Γυμνάσιο και 4ο Ενιαίο Λύκειο αντίστοιχα. Από το Σεπτέμβριο του 2002 συστεγάζεται στο σχολικό συγκρότημα της οδού Φιλιππουπόλεως μόνο με Α’ και Β’ Τάξη με Διευθύντρια την κ. Ευρυδίκη-Ελένη Αλεξανδρίδου και Υποδιευθυντή τον κ. Μιχάλη Μπιλιράκη, καθηγητή Οικονομολόγο. Η Γ’ Τάξη λειτουργεί σε παράρτημα, σε παλαιό κτίριο, όπου στεγαζόταν στο παρελθόν το 30ο Δημοτικό σχολείο, στην οδό Λασσαίας, σε απόσταση 500 περίπου μέτρων από το κτίριο της οδού Φιλιππουπόλεως, με Διευθυντή Παραρτήματος, τον Αναπληρωτή Διευθυντή, κ. Μανόλη Φλουρή και με Σύλλογο Διδασκόντων, ο οποίος μετακινείται ανάμεσα στα δύο κτίρια κατά τις ώρες των διαλειμμάτων.Το Νοέμβριο του 2002 γίνεται προσωρινή μετεγκατάσταση του 2ου Ενιαίου Λυκείου στο νέο σχολικό συγκρότημα στην περιοχή “Κηπούπολη”, σε πρωινή, πλέον, βάρδια. Η μεταφορά των μαθητών του 2ου Ενιαίου Λυκείου γίνεται με λεωφορεία, από και προς τον τόπο κατοικίας τους. Τις 20 Δεκεμβρίου 2003 γίνεται προσωρινή μετεγκατάσταση του 2ου Ενιαίου Λυκείου σε λυόμενες αίθουσες, επί της οδού Ανθηρού (περιοχή “Άγιος Ιωάννης Χωστός”) με λειτουργία πρωινή. Η μεταφορά των μαθητών του 2ου Ενιαίου Λυκείου γίνεται και πάλι με λεωφορεία, από και προς τον τόπο κατοικίας τους. Οι εργασίες για την ολοκλήρωση του νέου κτιρίου της οδού Κονδυλάκη για το 2ο Ενιαίο Λύκειο καθυστερούν απογοητεύοντας μαθητές, καθηγητές και γονείς. Μόνιμο αίτημα γονέων, μαθητών και καθηγητών παραμένει η άμεση αποπεράτωση της πτέρυγας του 2ου Ενιαίου Λυκείου, λόγω της παρατεταμένης ταλαιπωρίας της μαθητικής κοινότητας του 2ου Ενιαίου Λυκείου από τις αλλεπάλληλες μετακινήσεις της σχολικής μονάδος και τις απώλειες διδακτικών ωρών, λόγω της αναγκαστικής μετακίνησης των μαθητών με λεωφορεία, μακριά από τον τόπο κατοικίας τους.
Το Δεκέμβριο του 2004 γίνονται επίσημα εγκαίνια της πτέρυγας του 2ου Γυμνασίου και τίθεται πάλι επειγόντως το μόνιμο αίτημα του 2ου Ενιαίου για ολοκλήρωση των εργασιών. Το σχολείο έχει διακριθεί όλα τα χρόνια λειτουργίας του στις πανελλήνιες εξετάσεις για τα πανεπιστήμια με σημαντικές επιτυχίες. Παράλληλα τα τελευταία χρόνια συμμετέχει με επιτυχία σε διάφορα Ευρωπαϊκά προγράμματα και σε ανταλλαγές μαθητών με σχολεία της Ευρώπης. Επίσης πραγματοποιεί καλλιτεχνικές εκδηλώσεις και έχει διακριθεί στο χώρο του αθλητισμού. Το 2005 εκπροσώπησε την Ελλάδα στο «Forum για μια πολυπολιτισμική Ευρώπη 2005» που οργάνωσε το Λουξεμβούργο στο πλαίσιο της προεδρίας του στην Ευρωπαϊκή Ένωση.
Στις 11 Σεπτεμβρίου 2006 γίνεται ο αγιασμός στο νέο κτίριο της οδού Κονδυλάκη που αποτελείται από 20 αίθουσες διδασκαλίας 3 εργαστήρια (πληροφορικής, φυσικών Επιστημών, τεχνολογίας), αίθουσα βιβλιοθήκης και βοηθητικούς χώρους. Δίπλα στο κτίριο υπάρχει αμφιθέατρο πολλαπλών χρήσεων χωρητικότητας 300 ατόμων.
